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核心设施的Imaris

核心设施的Imaris是我们推荐的显微镜设备,大型实验室和多用户环境的图像分析软件包。Imaris是市场领先的宽视场、共聚焦(包括旋转盘)、光片、双光子、电子显微镜、CLEM、OPT和许多其他模式的可视化和分析软件,仅在2020年就发表了4000多篇论文。Imaris为核心设施提供复杂物体的智能检测和可视化、神经元、血管和其他丝状结构的跟踪、3D跟踪(包括细胞分裂检测)、交互式绘图和批处理分析。

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3D显微图像分析

核心设施的Imaris的力量在于我们的多种检测模型,以及它们为所有用户和他们的研究问题提供的多功能性。我们的4个模型(斑点、表面、细胞和细丝)可以用来检测和分析几乎所有的生物样本,包括细胞、细胞核、核仁、细菌、病毒、器官、神经元、树突刺、血管等等。将它们与Imaris的其他工具结合使用,就有可能分析物体随时间变化的动态,以及它们与图像中其他物体的关系,并以优雅和信息丰富的方式呈现这些数据。

表面

细胞

3D显微镜定量图像分析

在使用四种模型中的一种检测和分割图像数据作为目标后,Imaris计算了一个广泛的统计范围。所有的值都可以用于,过滤,标签,颜色编码,在Imaris中绘制(使用Vantage图)或导出一个预格式化的.csv或.xls文件。机器学习对象分类工具除了使用更多机器学习的特定值外,还使用了许多这些值。虽然下面列出的参数是生物学家最常用的统计类型,但Imaris报告了更多。

运动分析
  • 速度
  • 加速
  • 细胞分区跟踪
  • 弹道
  • 事件同步
量化
  • 物体的数量
  • 区域
  • 体积
  • 强度
  • 位置
的相互作用
  • 结构之间的距离
  • 卷重叠,联系人
  • 3 d强度分析
  • 空间分布
  • Co-localization
批处理和情节
  • 图像处理
  • 测量
  • 的相互作用
  • 组比较
  • 统计测试
丝/神经元
  • 长度,直线度
  • 平均直径
  • 分支角
  • 脊柱密度
  • 脊柱的形状
细胞
  • 体积
  • 每个细胞囊泡
  • 到膜的距离
  • 每个核囊泡
  • 形态学

每个人的图像分析

您的设施所有用户将在使用我们的向导驱动的智能工作流程和软件提示时遇到iMaris软件的简单性。为了改善学习曲线并促进我们的软件的使用,iMaris团队已准备好在线介绍性培训:图像可视化和分析在Imaris - Imaris家庭学校和众多短暂的视频教程

作为一项额外服务,Imaris团队可以为所有实验室成员或设施用户提供定制培训。培训可以在线(通过Amazon Web Services)或在用户设施现场进行。bob网app

对于个性化的工作流程(特定应用的帮助)和帮助,您可以随时联系Imaris的技术和应用支持团bob综合app官网登录队的图像分析和生命科学专家(包括在Imaris维护计划中)。我们鼓励所有用户让我们的专家团队帮助您获得最充分的利用他们的图像。

帮助您的用户与合作师共享他们的数据或在我们提供的家庭或会议上可视化他们的数据imaris查看器-免费软件,可以打开本地显微镜文件和数据集已经分析在Imaris。

灵活的许可选项

As a Core Facility Manager you may need greater flexibility than when a license is locked to one unique workstation so we have developed a Floating License Manager giving you the power to float the license to many different workstations within your lab, or department via your institution’s LAN. Expanded ranges beyond a department are available as well on request.

在希望在使用App Virtualization工具或工作站运行服务器操作系统的位置时,还需要使用iMaris时,还需要浮动许可证管理器。购买一个iMaris包许可证一次允许一次在一个工作站上使用imaris。如果您处于需要多个并发用户的情况下,可以购买其他许可证。

ClearView™GPU加速折垃圾

当用户需要锐化其图像时,去卷积通常是图像分析中的第一和重要步骤。imaris克服了常见的工作流问题,用户需要在各种软件包中打开他们的文件,通过将Deconvolution功能集成到iMaris菜单中,转换图像并保存多个副本。Imaris ClearView™Deconvolution的主要优点是:

用于光纸和共聚焦显微镜的大图像瓦片缝合

对于那些想要以高分辨率分析大样本的人来说,单独获取图像块的拼接是一项重要任务。核心设施的Imaris包括Imaris Stitcher,大多数Light-Sheet用户和一些共焦显微镜用户旨在获取这些大图像。Imaris Stitcher以易于使用和性能良好的界面满足了这些需求。通过在Imaris平台中加入拼接功能,我们消除了用户在软件间移动时将文件从一种格式转换为另一种格式所消耗的时间和存储空间。

用户将受益于:

额外的资源

imaris.学习中心主办了广泛的教程视频,如何到文章和网络研讨会,以指导您通过许多功能的Imaris。我们在下面提供了一些链接,让你开始了解我们的一些最新发展。