Imaris跟踪

用于跟踪的Imaris为3D和4D显微镜图像提供交互式处理，可视化和分析软件。具有最先进的量渲染状态，以及用于跟踪的对象检测和跟踪工具，非常适合想要自动分析移动对象的研究人员，包括随着时间的推移分裂的对象，创建谱系树图并从其图像数据中生成定量信息。现在，它包括在Imaris 9中引入的突破性技术，以解决当今图像分析的主要瓶颈 - 有效的量化和表面可视化数百GB Y千兆字节内的对象。

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在实际条件下对象检测和跟踪运动

用于跟踪的Imaris提供了经过验证的Imaris 3D跟踪算法的选择：布朗运动，自动化运动（专家），连接的组件或谱系，以生成不同类型的移动对象的最准确的跟踪结果。用户可以在新的徒手坐标系统（参考框架）中自动纠正翻译和旋转漂移或跟踪，也可以使用自动化选项进行漂移校正。

运动

使用提供的算法之一自动跟踪感兴趣的对象
处理数千个对象和时间点
使用多个可视化选项表示轨迹或位移
计算平均速度和瞬时速度，加速度
手动创建和编辑曲目

跟踪细胞分裂和谱系

使用所提供的谱系算法设计用于跟踪分裂细胞和核
探索从一个祖细胞到最后一代的细胞命运
自动创建一个可编辑的谱系树
标记带有彩色标签的选定的谱系树枝，并通过谱系分析您的数据
计算细胞周期持续时间，生成，第一分区以来的时间，自上次分裂以来

参考范围

可以在完整的细胞对象中检测和分析细胞质，核，核仁和各种囊泡。

建立一个新的坐标系，可用于在样品之间进行标准化测量，无论其初始方向如何。
可以在数据集框架内自由移动和旋转；可见和固定的飞机可用
在移动或旋转对象上设置参考框架，以分析内部较小对象的运动。旋转胚胎中的细胞，移动细胞内的囊泡，卵室内的边界细胞
在参考框架模式下播放延时序列，以使播放与之对齐
在标准和参考框架坐标系中获取统计数据

统计和测量

分段后，Imaris对所有检测到的对象，表面和斑点都会计算出广泛的统计信息。所有值都可以用于颜色编码，在iMaris内部绘制（使用Vantage图）或以.csv或.xls文件格式导出。下面介绍的参数是生物学家最常见的统计类型。Imaris报告了更多。

运动分析

平均速度
瞬时速度
加速度
轨道长度
细胞周期持续时间

表面

区域
体积
强度
精神
球体

斑点

位置（X，Y，Z）
强度
数字（计数）
距参考框架的距离

细胞周期

细胞周期持续时间
细胞周期位移
一代
自第一和上一个分区以来的时间

跟踪编辑和标签

用于跟踪的Imaris可以轻松地手动编辑自动跟踪的结果。使用标签添加其他描述性参数。

轨道编辑器

连接或断开对象以修改自动跟踪的结果
手动连接检测到的对象并创建新曲目，单元格或融合
对轨道或重组谱系树枝进行排序
添加缺失的对象并将它们连接到轨道
通过任何选择的统计参数同时为您的曲目和对象着色
导出跟踪结果为.tif或.svg

标签

添加带有颜色的标签，描述对象或一组对象的独特特征：来自同一母细胞的单元格，彼此接近的单元格，速度相似的单元格
根据分配的标签，颜色斑点和表面，以更好地可视化对象之间的关系
仅使用选定标签可视化对象
当导出统计参数时 - 标签充当附加的描述参数，并在选定组中进行进一步的分析。

可视化和动画导出

用于跟踪的Imaris提供了一组完整的功能，用于可视化多通道显微镜数据集，从静态2D图像到3D时间序列，无论其大小和格式以及多个图像和视频导出选项，以增强您的论文和演示文稿。

其他资源

这Imaris学习中心主持各种教程视频，操作方法和网络研讨会，以指导您完成Imaris的许多功能。我们在下面提供了一些链接，这些链接将使您开始使用一些最新的发展。

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