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Imaris 8.2发布说明

欢迎阅读Imaris 8.2发布说明。请看一下Imaris发行说明概述有关先前发布的功能和已修复的错误的信息。

发布日期:2015年12月16日

沿袭跟踪算法

Imaris8.2有一个谱系跟踪算法,允许跟踪分裂的细胞。谱系跟踪算法可在跟踪标签上的斑点,表面,细胞或细丝。

下面的截图显示了沿袭跟踪算法跟踪的点,并由“TrackID”着色。相同颜色的斑点来自同一个母细胞。

跟踪编辑器与谱系树可视化和统计显示

为了补充沿袭跟踪功能,Imaris8.2有一个新的轨迹编辑器,它将轨迹显示为“沿袭树”,使得显示中的交集数量最小(通常为零)。

轨道编辑器提供了有用的功能,可以使用“连接”和“断开连接”手动编辑轨道,并通过向左或向右移动轨道或翻转分支的方向,以不同的方式排列谱系树。新的轨道编辑器具有覆盖轨道颜色的功能。这可用于在轨道上以颜色的形式显示任何统计测量值。例如,它可以显示每个跟踪对象的第二个通道的强度。

下一节描述的“对象标记”功能可以用来突出谱系树的某些部分,如下图所示:

用于着色和统计输出的对象标记

用户可以为3D对象添加标签,如斑点、表面、细胞、囊泡等。这些标签可以用来对对象进行颜色编码。它们还作为出现在统计表和导出中的因素添加到每个对象的统计信息中。在下面的截图中,蓝色对象被标记为“快速”,橙色对象被标记为“缓慢”。颜色用于在3D视图中渲染。标签名称显示在统计信息中。

filereader

快速文件保存与并行gzip压缩

在8.2版中保存文件要比以前的版本快得多(高达5倍),这是由于图像数据的多线程gzip压缩。这适用于Imaris和ImarisFileConverter。

时间滑块显示帧数

objectid在编辑和删除期间保持不变

当一个对象被删除或添加或整个容器被复制时,Imaris分配给点、表面、细胞、核和囊泡的objectid不会改变。因此,id不再需要跨越整个数字范围。假设你有4个ID为1,2,3,4的点,你删除了ID为2的点,那么剩下的ID为1,3,4。

XTInterface

有一个新的函数“GetIds”,它返回统计中使用的objectid。

固定的错误

修复了Imaris 8.2.0中的65个错误
9120 在重新加载数据集时,灯丝“Pt总点数”统计值为0
9080 统计信息的id总是-1(仅Mac)
9060 Imaris应该在打开时尝试启动DataService
9056 试图打开一个不再存在的远程服务器上的文件将导致请求凭据的无限循环
8990 “迁移存储位置”失败,错误消息“无效的输入字符串”
8988 如果切换到“设置”选项卡,再返回“颜色”选项卡,轨道的可用颜色选项会发生变化
8987 如果批处理运行产生的文件对操作系统来说太长,则批处理将失败
8955 直接从exceed存储远程映像不会提示凭据
8936 Python在osx 10.11中不起作用
8918 删除单元格时崩溃
8893 打开带有批处理结果但没有查看结果的许可的图像时崩溃
8892 囊泡的细胞质数目应为无单位
8887 如果为远程位置添加的第一个文件不存在,Imaris无法从该位置添加其他文件
8883 导出功能不允许覆盖现有文件
8869 细胞/核中的通道索引编号与创建参数中的囊泡不一致
8862 Fileconverter 8.1.2在转换ZVI文件时增加了空白时间框架
8859 保存Coloc直方图没有结果
8845 如果组文件夹有冒号,从批统计导出结果将失败
8830 竞技场添加“组”和“图像”项目的快捷方式无法工作
8820 统计数据搜索Imaris时,搜索轨道ID崩溃
8817 在竞技场中搜索当前没有选择的文件夹将导致崩溃
8811 修改的关键帧动画不会被“Store”保存
8789 切换全屏模式时,时间条丢失
8786 不能在图像中放置注释
8778 在首选项对话框中不能正确显示单元格创建参数
8766 手动灯丝自动路径取消后崩溃
8764 增加Imaris管理弹出窗口的大小
8763 使用ImarisAdmin将DataStorage移动到Remote位置将导致映像不可用
8760 “Python 2.7应用程序”的路径不允许有空格
8758 如果属性选项卡不可见,则无法双击图像在竞技场视图中打开
8751 当选择多个文件时,“添加通道”、“添加时间点”和“添加切片”会导致崩溃
8750 计算对话框显示难看的格式和不再支持的操作系统
8749 Arena =>下拉缩放是缩小,不显示全文
8747 修改ImarisAdmin中的默认值应该会传播c…
8733 如果名字中有空格,Arena的搜索就无法工作
8709 当在“筛选器”选项卡上没有添加筛选器时,将选择“无跟踪”
8706 后续“存储”不“保存”删除通道。
8704 在超越中打开不支持的文件时没有错误消息
8698 Shift + cmd + p显示竞技场视图中的Annotation选项卡
8687 从动画导出窗口中删除QTVR选项
8681 从选择过滤器中删除有细胞核的单元格会导致崩溃
8676 如果在迁移期间Arena存储失败,应该通知用户
8673 在竞技场商店中无法使用取消按钮
8672 当前在图像处理选择下为弹出窗口选择的频道应该更清晰
8662 Imaris在删除Vantage图中引用的对象时崩溃
8635 AVI RAW导出(通过“另存为…”)并不是真正的“RAW”格式
8580 将图像添加到竞技场视图时忽略设置
8559 对于Imaris以前可以读取LSMExcitation和LSMEmission值的某些文件,不再读取这些值
8489 如果没有选择统计数据,向导中的统计数据计算将陷入无限循环或崩溃
8446 对于某些ND2, z刻度不能正确读取
8434 竞技场内的Tiff阅读器忽略设置
8391 重新采样“添加时间点”中忽略的设置
8355 存储Vantage参数后,创建选项卡从超越视图显示创建参数
8305 Imaris将崩溃时,用户正在做手动跟踪与斑点和龙尾巴被激活
8303 超越图像商店接受第一个图像的任何远程凭据
8124 当只启用Vantage许可证时,首选项对话框崩溃
8121 没有为动画或TimeMovie保存最后一个时间点
8049 首选项区域的默认大小应该更小
7847 点到点最近距离扩展没有足够的内存来处理客户数据集
7691 在7.7.0或更新版本中无法打开带有破碎灯丝段的ims文件,但可以在7.6.5中打开
7654 一些在Windows上可以正常打开的ZVI文件在Mac上无法打开
7632 Imaris在将现货时间索引设置为较大值时崩溃
7250 在Imaris中无法打开平铺时间序列
7247 无法在裁剪时间后保存(覆盖)ims文件
7236 自动连接不连接最后一个时间点
7002 Imaris XT“项目到2D”失败,文件大于2000像素

伊万里瓷器8.2.1

修复2个bug (Imaris 8.2.0起)
8783 无法正确读取LIF文件中的时间戳(来自新的LAX软件)
9324 Imaris 8.2.0 Track与LineageTrack的许可问题
9328 当Leica文件的RecordingDate值不存在时Imaris使用'-4713-11-24 00:00:00.000'