欢迎访问Imaris 9.1发布说明。请您看一下Imaris发布笔记的概述有关以前发布的特性和已修复的bug的信息。
版本日期:2017年12月19日
Imaris Stitcher是一个新的独立应用程序,可以将多个视野重叠的图像“缝合”成一个大视野的大图像。
Imaris Stitcher首先使用显微镜储存的舞台坐标对图像进行定位。如果舞台坐标是可用的,并且在Imaris Stitcher中第一次显示多个图像时,每个图像的位置几乎都很好。Imaris Stitcher中的“对齐”按钮可以精确地调整位置和对齐重叠的图像,使其内容匹配良好。下面是一个典型的例子:
如果你有一个文件,其中的舞台坐标ImarisStitcher不可用,你可以使用网格布局工具在网格上定位图像,或者手动移动图像,使其接近于与所有其他图像相关的位置。完成这一操作后,“对齐”按钮将负责找到精确的位置。
Imaris Stitcher需要IMS文件作为输入。Imaris File Converter是一个生成IMS文件的工具。在这个版本中,Imaris文件转换器的功能得到了改进,可以为ImarisStitcher生成输入。请参阅“文件系列与分割”和“文件系列分隔符可配置”。
在这个版本的Imaris可以覆盖两个不同的范围和体素大小的图像。可以对图像进行相对的平移和旋转,以方便对齐。例如,可以用相同样品的电子显微镜图像覆盖荧光显微镜图像。
当加载多个图像时,Imaris的大多数功能都可以用于每个图像。一些例外情况适用:体积渲染只允许在多图像场景中的MIP渲染。colc模块、Easy3D查看器和Gallery查看器不能用于多个图像。另一方面,从任意一幅图像中都可以计算出斑点或其他物体。而Imaris 9.1甚至会计算其他图像的统计数据,当物体与另一张图像重叠时。
在Imaris 9.1中,3D视图中的帧对象允许定位图像。在多图像的情况下,会出现多个帧对象,每个帧对象可以与加载的图像中的一个相关联。当帧对象的位置选项卡被选中时,一个小的“三脚架”出现在3D场景中。当三脚架移动或旋转时,点击中心或轴,并操纵其位置的图像跟随。这允许在多图像设置中一个图像相对于另一个图像的有效粗定位。为了进行精确定位,可以使用框架对象的位置标签上的按钮进行小的更改。
参考框架对象在Imaris是非常有用的,以创建相对于特定位置或图像方向的测量。为了便于定位的参考框架,它有一个小“三脚架”,人们可以用鼠标点击,然后重新定位。在这个版本的Imaris中,鼠标与“三脚架”的交互处理得到了显著的改进,使参考系的定位比以前更简单。此外,三脚架的大小现在耦合到屏幕,而不是图像体素大小。这使得非常精确的定位在高变焦水平。
文件系列设置允许选择“分割”,以便将一个系列分割成多个IMS文件。这允许轻松地将由多个视图字段组成的系列转换为多个IMS文件。如果视场重叠,这些文件可以很容易地在ImarisStitcher9.1中打开,并缝合成一个大的视场。
可配置的文件系列阅读器自动将系列文件名的部分解释为分隔符,以指示X、Y、Z、C、T或F维度的不同索引。这些分隔符可以在ImarisFileConverter或Imaris的Preferences(在Loading选项卡)中配置,如下所示:
9.1修复了53个bug | |
5504 | 图像过程——>通道移位2D失败 |
7152 | 如果体素尺寸较小,轮廓工具无法创建曲面 |
7428 | 统一表面撞击Imaris |
7535 | 带有许多物体的表面组件的透明度生成缓慢 |
7590 | 图像处理后没有更新强度统计 |
7598 | IQ TIFF文件分割成通道未正确读取 |
7598 | IQ TIFF文件分割成通道未正确读取 |
7812 | 重建不会在新数据集上生成表面或统计信息 |
8493 | 旋转3D视图时变焦的极端变化 |
8805 | 动画在回放过程中“跳跃” |
9108 | 动画关键帧应该在加载新数据集时清除 |
9117 | Imaris无法正确读取奥林巴斯vsi数据集信道信息 |
9124 | 导出数据为“开放显微镜环境tiff”,来自不同维度的信息不会被完全分割 |
9321 | 竞技场不显示存储文件的缩略图,化验文件夹视图为空 |
9500 | “导入表面到单元格”对象被ROI边缘偏移 |
9522 | 自定义统计“ID”的颜色编码崩溃 |
9695 | 多图像VSI文件读取不正确 |
9810 | Mac OSX 10.12.1的顶部菜单栏消失且无法恢复 |
9918 | 在多图像CZI上运行批处理无法显示3D对象和统计数据 |
9942 | 灯丝手动跟踪解决方案(连接和断开从8.2起失效) |
10029 | 体积渲染8.4.1比8.3.1更亮 |
10073 | Imaris无法读取VSI文件 |
10161 | 细胞外的x张囊泡报告到细胞的距离为整数值 |
10178 | 调色板“删除选中”导致Imaris挂起 |
10180 | 在Easy 3D中初始渲染可以是空白的 |
10209 | 轮廓面掩模在首次绘制轮廓后开始切片 |
10213 | 按下快照按钮时,时间条会移动 |
10256 | 切片器视图变灰 |
10263 | Imaris在将Cell导出到surface时崩溃 |
10264 | 跟踪小点崩溃时,播放来回 |
10276 | 如果使用“添加组件到当前场景”选项,新的。ims场景文件不能正确导入表面或单元格 |
10281 | 当你试图保存细胞跟踪和裁剪时间崩溃 |
10309 | 当使用“后退”按钮时,在表面向导中启用子卷会使Imaris崩溃 |
10339 | Imaris退出而开始时,没有许可证启用 |
10348 | bpManualBuilder的警告在报告电子邮件中不可见 |
10353 | 如果最小值和最大值相同,普通着色渲染不会更新 |
10354 | 一些细胞强度相关的统计数据将在第6个显著数字上有所不同 |
10355 | XT衰减正确,有时会造成碰撞 |
10367 | Tiles CZI文件仅部分加载 |
10391 | 在混合渲染时加载另一张图片导致Imaris崩溃 |
10412 | 来自Thorlab的口角撞到了Imaris |
10414 | 检查9.0.1到9.0.2的更新窗口没有显示发布说明 |
10416 | PC上的FileConverter不允许使用Unicode字符 |
10419 | 在HKEY_CLASSES_ROOT下的Imaris Open命令卸载后会失去其值 |
10424 | 一些zvi文件没有正确读取 |
10425 | 自动调整所有频道时,没有数据集将崩溃Imaris |
10432 | Imaris挂起试图计算在XT中创建的频道的统计数据 |
10433 | 为时间序列删除断开的段崩溃 |
10440 | Imaris误读了一些.czi文件的时间间隔 |
10442 | 使用XT添加灯丝太慢 |
10482 | Imaris崩溃按Ctrl+C没有加载数据集 |
10545 | 创建彩色编码区域通道被破坏 |
10546 | 删除所有切片会导致Imaris崩溃 |
10549 | 只能识别一个CZI文件的图像 |
修复了Imaris 9.1.0以来的8个bug | |
10259 | 添加参考帧为表面添加了基于参考帧的强度统计 |
10587 | 一些OME tiff文件的ImplExtend显示值为-0 |
10615 | 参考帧统计错误(忽略旋转) |
10664 | CZI瓷砖开放在缝合完全离开舞台坐标 |
10666 | 参考帧播放模式打断相机,什么都看不到 |
10669 | 参考框架>飞机设置为可见结果在Imaris坠毁 |
10681 | 与9.0.2相比,Imaris 9.1打开LIF文件非常慢 |
10696 | 这些Andor多tiff(系列)文件的通道颜色读取错误 |
修复了1个Bug(从9.1.1开始) | |
10715 | Imaris 9.1.1在缩放或平移任何数据集时挂起 |