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Imaris 9.2发布说明

欢迎来到Imaris 9.2发布说明。请您看一下Imaris发布笔记的概述有关以前发布的特性和已修复的bug的信息。

版本日期:2018年6月6日

快速渲染点和轨道

Imaris 9.2可以交互渲染数百万个点。新的高效渲染器极大地提高了spot和track渲染速度,使普通图形硬件上的快速渲染成为可能。

支持快速点和轨迹渲染的技术基于以下特性

快速点计算

点的计算以块方式和多线程方式进行。它有效地使用系统资源,避免数据分页到文件。从大的3D图像和大的时间序列中有效地计算点是可能的。

快速跟踪算法

在Imaris9.2中,每个时间点可以有效地跟踪数千个目标。改进了线性分配求解器,提高了布朗运动、自回归运动和沿袭跟踪算法的计算速度。

在点编辑时避免重新计算统计

当编辑点或轨道统计将重新计算,只有那些对象需要重新计算。对于大数据,这可以显著提高更新统计数据所需的时间。

多选择点编辑和表面编辑标签

现在可以使用单击单击选择多个斑点。在斑点以及曲面编辑标签上,可以启用三种不同的选择模式:“点”,“圆”和“框”。“点”是点击选择直接在鼠标Poniter下的正常选择模式。在“圆圈”模式下,屏幕上的鼠标指针周围出现圆圈,然后按左键单击将选择所有中心位于圆圈内的斑点。按Ctrl +左键单击将添加到现有选择,如果某些未选择的斑点在圆圈中,则否则将取消选择圆内的所有斑点。可以使用鼠标滚轮更改屏幕上的圆圈的大小。

请注意,当选择的点是曲目的一部分时,曲目编辑器选项卡的“鼠标选择”的设置决定了如何扩展选择,例如选择整个曲目。

在方框模式下,光标周围的屏幕上会出现一个3D方框。该框定位为3D,当使用左键单击或Ctrl+左键单击时,中心在该框内的点将被添加或从选区中删除。

跟踪编辑与重点和改进的使用

使处理大量的跟踪轨迹编辑器(默认关闭)重点跟踪模式中只有少量的铁轨将显示在trackeditor和那些显示将决定基于他们接近时选择跟踪“重建选择”。这允许将焦点放在与所选轨道相近的轨道上。

跟踪编辑器“连接”,“当前时间点断开”,“断开所有”按钮

在最近的Imaris版本中,连接和断开轨道非常困难。在版本9.2中,可以有效地连接和断开轨道。“连接”按钮允许通过将轨道的第一个对象扩展到另一个选定轨道的前一个对象来连接选定轨道。“在当前时间点断开选定对象”按钮通过删除到以前时间点的对象的连接,在当前时间点中断选定的轨道。“断开所有选定对象”按钮删除所有连接(注意!如果你不小心点击了,试着立即点击“连接”)。

Statistics选项卡支持大数据

Imaris9.2中的对象统计选项卡能够交互处理大量对象。

标签跟踪

在Imaris9.2中,可以为音轨分配标签。因此,可以获得分配的标签来跟踪统计信息,并使用统计信息导出它们。也可以在颜色标签上使用“只显示有标签的对象”来只显示那些有标签的轨道。

新文件的读者

通用电气Incell

固定的错误

imaris 9.2修复了错误
10939 当在分类轨道和跟踪步骤之间切换时,直方图计数越来越多的轨道
10937 统计选项卡中的Sholl半径排序错误
10900 从XT距离变换通道创建Imaris9表面忽略像素强度为“0”
10855 轨道线宽度大于4在Mac上不显示任何东西
10853 当从Filament中删除过滤的树突时崩溃
10836 当使用ROI时,灯丝向导崩溃
10821 “灯丝统计导出”创建的文件无法在Excel中打开
10820 Cell Distance to Image Border is missing Image information "Img=1"
10809 当启用种子点分裂时,表面不再被检测到
10803 使用种子点分裂表面与较高和较低的阈值崩溃Imaris困难
10766 背景减法“滤镜宽度”参数输入被忽略
10742 “Import Surface to Cell”只从第一个旧的表面对象导入
10741 在创建向导中单击“完成”后,单元格丢失
10734 点手工放置只在数据集1024x1024x1的中心工作
10725 某ims文件在3D视图下无法正常打开
10724 分水岭忽略地表种子点
10723 裁剪3D窗口调整大小不改变图像显示区域
10722 Imaris没有正确加载该VSI映像的元数据和数据类型
10720 当在点编辑模式中选择“特定通道”时,Imaris在恢复时冻结
10706 现场手动跟踪-第一个时间点错位
10704 在第二个2D图像上创建细胞导致Imaris崩溃
10689 Coloc标签可以在多图像模式下使用,崩溃了Imaris
10684 重命名的OMETIFF在保存为新的omtiff时没有更改文件名
10679 Imaris Stitcher在。czi图像的瓷砖上失败了
10677 从直到光子学软件崩溃的OME TIFF文件
10672 内存不足导致AutoDepth算法崩溃
10667 “帧率”选项灰色时,出口电影为“Raw电影”在Windows
10665 该数据集的适合/重置/缩放被破坏
10663 File Open对话框创建一个中断工作流的nullWindow
10651 当编辑手动创建的灯丝时,会出现硬崩溃
10647 Crop3D在伊马里斯9.1造成致命撞车
10641 CZI 3D时间序列卷数据未读取
10620 如果时间点范围无效,Imaris在删除时间点时崩溃
10613 在导入到细胞时表面的损失
10611 当一些物体不在第二幅图像中时,基于第二幅图像强度的颜色编码对象是不正确的
10607 Imaris在删除Vantage的2D表面时崩溃(时间vs区域)
10594 中心点表面可视化不提供子体积选项
10578 打开图像重采样略大的文件导致Imaris冻结
10577 轮廓面掩码在掩码通道的中心产生一条假线
10564 Imaris错误地显示由Metamorph软件生成的ND文件的元数据
10558 一些vsi文件以前被读取为Z=1,现在被读取为Z堆栈与一个重复的单片
10533 Imaris错误地将tiles检测为这个幻灯片文件的时间点
10461 漂移校正后的参考帧统计不显示
10413 OS-X上的imaris 9无法读取.oib文件,先前可以在imaris 8.4.2上读取
10374 “物体表面”在“倾斜切片机”上不起作用
10363 切割一个表面多次最终会导致碰撞
10351 批处理完成所有文件,达到100%进度,但状态仍在运行,集合无法打开
10295 距离变换失败的表面,大型2D数据集
10292 如果十字线“关闭”,则在区段视图中禁用尺寸控件
9966 保存的批处理参数不复制表面结果从Arena中看到的Imaris本身
9599 由ImageJ 1.51f(斐济)导出的TIFF的体素校准未读取
9226 在“Details”统计中选择几十个项目是非常慢的
9069 从对象中删除标签时,不会在统计列表中删除标签
7827 3D图像60,000或更多的点需要很长时间加载统计标签
6919 对于大量的时间点,平均值很慢
6411 如果“Edit Track”标签有很多单点激活,Imaris会被阻止
4578 没有显示重复掩码通道的通道名

伊万里瓷器9.2.1

修复了10个bug(从Imaris 9.2.0开始)
11053 有些图片不再被识别为Micromanager
11033 徕卡LIF文件中的图像数据在Imaris 9.x中没有被正确处理
11028 Imaris错误地转换了反卷积的徕卡。lif文件
10986 Leica .lif文件在Imaris 9.0或更高版本无法打开
10954 Imaris缝合器不从Deltavision (.dv)文件读取舞台坐标
10898 LIF文件打开错误从徕卡马赛克瓷砖
10887 缝纫机浮动许可证不工作
10852 错误读取。lif文件中的某些图像
10591 这些oif文件的阶段位置没有正确读取
10519 CZI FileReader不能正确处理多文件数据集