图像处理批处理管道

欢迎来到Imaris 9.3教程:仅用于图像处理的批处理管道-设置和查看结果

在本教程中，我的目标是使用相同的设置处理实验中的多个图像。

在这里，我想取消所有的通道。

要开始设置一个新的批处理管道，只需选择新批处理图标。批量管道创建者包含两个主要步骤:批量设置步骤1 -图像处理和批量设置步骤2 -对象检测。您可以设置这两个步骤构建的批处理，也可以跳过不需要的步骤。

在本教程中，我将向您展示如何设置和保存一个批处理图像处理管道，以及如何查看结果。

在批量设置步骤1 -图像处理中，左侧有一个图像处理管道，中间有图像处理预览窗口。现在，您可以从所选通道旁边的下拉菜单中选择图像处理功能。这里我想要反卷积所有通道，所以我选择红色通道的反卷积并设置参数。

该图像是利用旋转圆盘共焦获得的。在这个例子中，大多数获取参数都是自动从元数据中读取的，

我只从浸泡介质下拉菜单中选择硅油。

请观看Imaris ClearView反卷积教程，了解更多关于其他选项。设置了红色通道的参数后，可以将设置复制并粘贴到其他通道。如果需要，您也可以为选定的通道设置额外的图像处理步骤，但在本教程中我将跳过这一步。结果立即在预览窗口中可见。如果您对预览满意，请按管道编辑器底部的“Next”按钮。这将把您带到批处理设置步骤2-对象检测，但由于您只想解除卷积您的图像，跳过这一步。确保默认选项“批量存储处理过的图像已勾选”，并按“确定”按钮。

在弹出窗口中，输入一个新批处理的名称-反褶积批处理。现在我们再次回到竞技场。有一个新的绿色箭头缩略图表示我们新创建的批处理管道。首先，我想告诉你，协议是写在同一个文件夹的图像，当你复制文件夹到另一个位置，批处理协议将在那里(右击，显示在资源管理器)。

现在我将专注于编辑和执行批处理图像处理管道。用鼠标左键单击突出显示批处理协议缩略图-批处理协议属性出现在右面板中。在那里我可以快速查看我的Batch的内容。要编辑此管道，请单击上面的铅笔图标。要在向导中修改Batch管道，请选择紫色向导图标(Edit)。这个选项会让你再次进入编辑器，在那里你可以精确地修改图像处理批处理协议，甚至在上面添加对象检测。如果你只是想删除一个“砖块”选择命令为一个通道，右击并删除一个砖块。

一旦协议准备好，右键单击“批处理缩略图”，并选择Run Batch或Run Batch(如果父文件夹中有其他子文件夹)，其中包括子组。批处理总是处理文件夹中的所有图像。

批处理进度条出现在右侧面板中。一旦任务完成，您将在所有图像名称旁边看到绿色的标记。现在你可以看到每个缩略图都有一个图标，显示它包含2个图像。事实上，这两张图片都保存在驱动器上:原始的和处理过的，但为了简化，在Arena中你可以看到一个缩略图。双击缩略图，默认情况下打开处理后的图像。通过使用恢复点，你总是可以在Arena中将处理过的版本恢复到以前的版本或原始版本。