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伊万里瓷器的必需品

Imaris Essentials Package是一款交互式可视化和分析软件,适用于3D和延时显微镜图像,具有大数据集(Terabyte范围)的高级解决方案——基于我们的多分辨率技术的智能体积和表面渲染,以及无限大小的图像的表面计算。Imaris Essentials Package是完美的研究人员谁需要一个易于使用的软件来制作惊人的快照和动画,从他们的显微镜数据生成定量信息,对象到对象的距离和重叠测量,共定位研究,绘图和统计分析。Imaris Essentials包包括易于使用的机器学习对象分类器和标签。

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显微镜的三维可视化和渲染

Imaris Essentials提供了一套完整的功能,用于可视化多通道显微镜数据集,从静态2D图像到3D时间序列,无论其大小和格式。使用Imaris Essentials用户可以:

  • 组织和管理完整的实验,包括图像和数据分析
  • 使用高级的3D/4D体绘制模式:(MIP,混合,阴影投影,普通阴影)
  • 受益于Imaris的高性能IMS文件格式,即使在非常大的数据集(Gigabytes到Terabytes范围)中也能保证平滑导航
  • 结合体绘制,对象表示,剪切平面和2D切片器
  • 轻松制作高质量的动画和高分辨率快照,为演示和出版物做好准备

定量显微镜图像分析。物体的检测

Imaris for Essentials提供了多个选项,通过逐步向导,在工作流的每个点预览结果,来检测和建模与生物相关的结构。

表面

使用Imaris 3D表面精确可视化和测量各种物体的形状在你的样品,如细胞器,细胞核,生物膜,细胞,组织,器官,胚胎,组织以及整个有机体。

  • 数据集中感兴趣的指定区域的表示形式
  • 基于全局或本地阈值计算或基于用户定义的兴趣区域创建
  • 可以计算和可视化的数据设置到tb大小
  • 充当一个容器,从中可以计算所有所需的统计信息

利用Imaris斑点检测:颗粒,蛋白质簇,囊泡,核仁,细胞核,中心体,细胞和细菌。

  • 在数据中模拟点状或囊泡状结构。
  • 可以在含有10到100个物体的图像中识别。
  • 计算每个物体的XYZ坐标,可以测量到与其他物体的相对距离
  • 可实时跟踪(5种高性能运动算法)

机器学习对象分类

使用可训练的机器学习分类器(ML)自动分类检测对象(细胞,细胞核,囊泡),基于选定的统计或两种特征的组合。类被标记并可用于可视化表示、绘图和下游分析(统计数据的导出)。

  • 可训练机器学习分类器
  • 对象分类基于其所在环境或内在特征
  • 标签-分类对象的标签(颜色和名称),这是导出的统计
  • 比较标记类的可能性

距离测量,空间交互作用和共定位

根据生物结构在三维空间中的分布,Imaris Essentials提供了多种方法来研究生物结构之间的相互作用。Imaris Essentials包括Coloc -最强大的共定位分析工具,量化和记录多种染色生物成分的共分布。

  • Pearson系数,Mander系数,共定位体素,在感兴趣区域(roi)内计算的共定位百分比
  • 到最近的点或表面的最短距离
  • 统计计算如果选定的点被吸引到表面感兴趣
  • 表面之间的体积重叠

绘图工具和数据挖掘

Imaris Essentials包括一个无缝集成的工具来探索实验组之间的差异(例如控制vs测试)- ImarisVantage。它允许创建互动情节,帮助说明对象测量或对象组之间的关系/模式/差异,并揭示隐藏的关系。

  • 二维散点图
  • 空间分布的阴谋参考物体周围的随机分布
  • 单维箱线图组比较
  • 组比较: t检验、f检验、wilcoxon检验、Kolmogorov-Smirnov检验
  • 互动对象画廊
  • 互动多维对象散点图

额外的资源

伊万里瓷器的学习中心主办了广泛的教程视频,如何到文章和网络研讨会,以指导您通过许多功能的Imaris。我们在下面提供了一些链接,让你开始了解我们的一些最新发展。你也可以看看有什么新的最新版本的Imaris