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DNA折纸模拟蛋白质成核剂来指导淀粉样纤维的形成

中国和美国的研究人员使用DNA折纸作为分子成核剂研究了卷曲纤维的聚合。高分辨率,视频速率AFM地形成像揭示了单分子水平上纤维形成动力学的细节。

AFM形貌片显示DNA折纸存在时卷曲聚合用DNA折纸进行卷曲聚合的AFM地形图电影

淀粉样纤维是具有广泛生物学功能的蛋白质聚集体。一个例子是卷曲纤维,一种存在于动物生物膜中的功能性淀粉样蛋白大肠杆菌细菌。众所周知,细胞通常使用分子规模的成核剂来介导这些原纤维的形成,以确保适当的结构和功能。然而,这一过程的许多细节尚不清楚。

在这项工作中,上海理工大学的研究人员领导的一个团队利用原子力显微镜技术对纤维的形成有了更深入的了解。他们用卷曲特异性基因B蛋白修饰DNA折纸,以模拟蛋白成核剂。高速地形图电影允许在单分子水平上直接可视化纤维组装动力学,而特写地形图图像提供了进一步的见解。实验表明,卷曲装饰的折纸以两种不同的方式刺激纤维生长。

这一结果为探索成核剂如何调节纤维聚合提供了一个体外平台,有利于生物纳米技术和医学的广泛应用。bob综合app官网登录

复合图像显示的原理图,AFM地形电影的框架,原纤形成独立和卷曲装饰DNA折纸的kymograph

使用的仪器

塞弗VRS原子力显微镜,三维原子力显微镜

使用的技术

用光学显微镜获得了纳米级形貌的电影轻敲模式在液体上塞弗VRS原子力显微镜. 电影中的延时图像显示在主要论文中,而整个电影可在期刊网站的补充信息中获得。每帧大约6秒,这些电影展示了VRS捕捉纳米级动态过程的能力,分辨率和标准的易用性塞弗原子力显微镜. 额外的地形图像是在地面上采集的三维原子力显微镜在液体和空气中轻敲模式,以更仔细地检查原纤维和折纸结构。

引用:Mao X., K. Li, M. Liu等。DNA折纸成核体定向卷曲聚合。纳特。公社。10, 1395 (2019).https://doi.org/10.1038/s41467-019-09369-6

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